2단에는 곱해진 수의 합을 기본수로 만들면 숫자가 ‘2, 4, 6, 8, 1, 3, 5, 7, 9’의 아홉 수가 모두 등장하였는데, 3단에는 ‘3, 6, 9’의 세 숫자만 나타난다는 점도 매우 흥미롭다. 구구단은 2단만 그런 것이 아니라 모든 단이 1에서 9에 이르는 아홉 개의 숫자가 배열만 달리할 뿐, 모두 등장하는데, 유독 3단과 6단, 9단만이 그렇지 않다. 그중에서도 3, 6, 9의 세 숫자만으로 이루어진 것은 3단과 6단의 두 개밖에 없다. 9단은 9개의 숫자가 모두 9로만 이루어져 있다는 것도 음미할 만한 부분인데 이는 곧 모든 수의 총결정판이 9단이기 때문이다. 3단과 6단은 3, 6, 9라는 세 개의 숫자로 이루어지지만 3단의 중심은 3 × 5 = 15(6)가 되어 6이 중심을 이루고, 6단은 6 × 5 = 30(3)으로 3이 중심을 이룬다는 점이 다르다. 물론 9단은 모든 수의 결정판이므로 중심은 9 × 5 = 45(9)로 9가 된다. 이처럼 3단과 6단, 9단이 다른 단과 다른 까닭은 3은 天一, 地二의 끝인 人三이기 때문이요, 6은 天四, 地五의 끝인 人六이기 때문이며, 9는 天七, 地八의 끝인 人九이기 때문이다. 즉 3, 6, 9는 천지인의 종(終)을 상징하기 때문이다.
3단의 세부적인 의미는 다음과 같다. 3 × 1 = 3은 하늘에 있는 천지인 3신을 가리킨다. 땅에 드러나는 3신은 3 × 2 = 6이며, 인간 속으로 드러나면 3 × 3 = 9가 된다. 3은 하늘(1) + 땅(2)의 합이므로 인간이라고 한다. 따라서 3은 하늘에 있는 무형의 인간이요, 6은 땅에 있는 유형의 인간이며, 9는 유, 무형을 합한 인간이라고 할 수 있다. 하늘에 있는 무형의 인간은 형체가 없으므로 신이라고 할 수밖에 없기에 3신이라고 한다. 땅에 있는 유형의 인간은 형체가 있긴 하지만, 물질의 근본인 기(氣)의 상태를 취하기 때문에 6기(六氣)라고 한다. 9는 이 둘을 합한 상태이므로 3신과 6기를 모두 담고 있는 궁이기에 9궁이라고 한다. 따라서 3, 6, 9를 합한 18은 3신이 천지인 삼계에서 한 번 운행한 상태를 가리키는 것인데 이를 가리켜 18변이라고 한다. 18변은 지감(止感), 조식(調息), 금촉(禁觸)이 각기 전, 후, 상, 하, 좌, 우로 상응(相應)하는 상태를 말한다.
6기로 상징되는 6는 1 + 5의 의미도 있으니, 이는 곧 형상의 중심 5에 하늘의 신인 1태극이 응기(凝氣)한 상태를 가리킨다. 1태극은 아직 음양으로 분열되기 전의 상태이므로 물과 같이 한 곳에 모일 수밖에 없는데, 그것이 형상의 중심에 자리를 잡게 되면 비로소 기가 작동한다. 이를 가리켜 6수(六水), 6기(六氣)라고 한다. 6은 또한 2 +4 = 6이라고도 할 수 있는데, 이는 곧 음양과 4상을 합한 것이다. 만약 음양이 4상속에서 움직인다면 2 × 4 = 8이라고 해야 한다. 3신이 음양을 움직이면 2 × 3 = 6기다. 3신이 비록 음양과 함께 있어도 아직 움직이지 않고 있다면 2 + 3 = 5라고 해야 한다.
3 × 3 = 9도 1 + 8로 생각해 볼 수 있다. 8방속으로 1태극이 중심을 잡은 것이 9궁이다. 아무리 형상이 8방으로 벌어졌다고 하여도 만약 중심에 1태극이 없다면 이는 표면에 지나지 않는다. 그러므로 8은 항상 표면을 가리키는 것일 뿐, 중심이라고 할 수는 없다. 그러기에 8은 8괘, 8방이라고 하지만 9는 9궁이라고 한다. 8의 배수인 16도 표면을 가리키고, 3배인 24도 표면을 가리킨 것이며, 4배인 32도 마찬가지다. 9를 이루는 것으로는 2 + 7 = 9도 있다. 이는 음양과 7성의 합을 가리키는데, 7성이 음양으로 벌어질 준비를 마친 상태가 9라는 의미다. 7성이 음양으로 움직이면 9가 아니라 2 × 7 = 14라고 해야 한다. 3 + 6도 9를 만드는데, 이는 하늘의 3신과 땅의 6기가 합한 상태다. 즉 3신이 6기를 얻어 바야흐로 18변을 할 준비가 완료된 상태를 의미한다. 그러므로 9는 3신이 모든 준비를 완성한 모습이며, 그것으로 기본 숫자는 끝이 나고, 다시 0으로 돌아가 새로운 세계가 펼쳐진다. 4 + 5도 9가 되는데, 4방과 형상의 중심이 합해진 상태다. 4방에서 5행이 움직이면 20이 되지만, 4방에 5행이 갖추어지면 9가 된다.